Bilgisayar ve Yazılım Mühendisliği bölümlerinin alan dersleri açık kaynak sistemleri kullanılarak kurulan bilgisayar laboratuvarlarında yapılmaktadır. Dersler için 2 adet 55 kişilik bilgisayar laboratuvarımız bulunmaktadır. Laboratuvarlarımızdaki bilgisayarlarımızda Pardus işletim sistemi kurulmuştur. Ayrıca laboratuvarlarımız Ulakbim tarafından geliştirilen Lider-Ahenk ile yönetilmektedir. Ders laboratuvarları haricinde bir de Blokzincir araştırma laboratuvarımız bulunmaktadır. Araştırma laboratuvarımızdaki bilgisayarlarda ağırlıklı olarak Pardus işletim sistemi kurulu olmakla birlikte bazı bilgisayarlarda farklı linux dağıtımları da vardır. Laboratuvarımızdaki çalışmalar uygulamalar sanallaştırılarak (Docker, LXC, Virtual PC, Proxmox, vs) sürdürülmekte ve masaüstü yazılımları (Libreoffice, kod yazmak için kullanılan ideler, vs.) Pardus repolarından kurulmakta veya dockerize edilmiş versiyonlar veya uygulama görüntüleri (appimage) ile çalıştırılmaktadır.